Большое количество атмосферных осадков породило развитие в Малайзии плотной гидрографической сети. В этой стране нет больших рек, и все из-за размеров территории Малайзии и конфигурации рельефа. Ни одна река Малайзии не может даже сравниться с крупными реками Таиланда, Индонезии, Бирмы, не говоря уже о реке Меконг.
Самыми крупными реками Полуостровной Малайзии являются Перак, Паханг, Келантаи, Джохор и Малакка. Паханг, самая длинная из них, имеет продолжительность всего лишь 320 км, а Перак и того меньше - 270. Длина рек на Северном Калимантане значительнее. Например, длина Раджанг составляет 560 км, у Барам - 500, река Лимбанг - 195 км, а у Лупар - 227 км. Сабаха - Кинабатанган, самая большая река, имеет длину 560 км. К другим значительным рекам относятся Сабаха - Падас, Сегама, Лабук.
Реки Малайзии в течение всего года довольно многоводны. Нужно отметить, что в период дождей уровень воды резко повышается, и часто бывают наводнения. Во время разливов затопляются огромные площади прибрежных низменностей. В местах, где потоки прорезают горные массивы, у рек очень быстрое течение, они изобилуют многочисленными порогами и водопадами. Проходя по горным районам, водные потоки несут с собой большое количество различного материала. При выходе на равнину течение становится медленнее, и на дно оседает песок и ил, которые в устьях формируют бары и отмели, препятствующие судоходству.
В верхнем течении многие реки служат хорошим источником гидроэлектроэнергии. Потенциал Малайзии приравнивается к 30 млн кВт, 71 % из которых приходится на Саравак, 16 % - на Сабах и 13 % - на Полуостровную Малайзию. Но эти цифры иногда вызывают сомнение, ведь, по некоторой информации, гидроэнергетические ресурсы одного Саравака составляют почти 70 млн кВт.